一、按照农业部颁标准，三者概念为：
1、有机肥，指主要来源于植物或动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。经过无害化处理的有机肥称为精制有机肥。本文中有机肥指精制有机肥。
2、生物肥，指由特定微生物与营养物质复合而成，能提供、保持或改善植物营养，提高农产品产量或改善农产品品质的活体微生物制品。包含复合微生物肥料。
3、生物有机肥，指特定功能微生物与主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。

二、三者区别与相似点：

1、三者相似点：
（1）都具有肥料的功能，均为植物提供营养；
（2）都含有一定数量的微生物菌落；

2、三者区别点：
（1）所含微生物种类与作用不同：
   A、有机肥通过发酵微生物作用而腐熟，其所含微生物种类相对较多，各自数量多少不一，主要为无害化作用后剩余的耐高温、活性高的微生物，对作物生长发育不一定都具有积极作用；
   B、生物肥所含微生物一般为在灭菌处理营养基质上所接种微生物的繁殖产生的后代，微生物种类特定，多为功能性有益微生物，对植物生长发育起积极作用。
   C、生物有机肥所含微生物主要为在精致有机肥中添加特定功能性微生物。对植物生长发育起积极作用。
（2）功能侧重点不同：
   A、有机肥以提供植物营养为其主要功能，其养分经过微生物发酵分解供作物吸收利用。它能改善土壤结构，同时为微生物生命活动提供能源和养分，促进土壤微生物的活动，因而能有效地调节土壤中水、肥、气、热，从而提高土壤肥力；
   B、生物肥主要功能在于以微生物生命活动的产物来提高土壤肥力，刺激植物生长，或抑制有害微生物的活动，增加作物的抗病力和抗逆性，促进作物对养分的吸收，提高农产品产量或改善农产品品质。对土壤、肥料中营养起转化增效作用，并不足以代替其它肥料。
   C、生物有机肥则将二者功能有机合理的予以融合，既克服了有机肥肥效迟缓，又克服了生物肥作用发挥易受环境、对象等特点制约作用，利于发挥菌肥和有机肥有互补增促作用，产生1+1>2的效果。